Développé par l’IFB, madbot est un outil conçu pour accompagner les chercheurs dans la gestion, la description et le partage de leurs données scientifiques. Face à l’augmentation continue du volume de données de recherche, il devient de plus en plus complexe de garantir leur accessibilité, leur réutilisabilité et leur compréhension sur le long terme.

Madbot apporte une réponse à ces enjeux en proposant une solution automatisée, standardisée et flexible, conforme aux standards internationaux de métadonnées. Il permet de structurer et de décrire les données de façon cohérente, tout en apportant un gain de temps considérable à cette étape.
Madbot contribue également à garantir une description correcte et cohérente des données, conformément aux normes établies. Cela facilite leur recherche et leur utilisation ultérieure. L’outil se connecte à diverses plateformes internationales telles que Zenodo et ENA (European Nucleotide Archive), permettant aux chercheurs de soumettre directement leurs données à ces référentiels en toute simplicité. L’interface intuitive de madbot permet aux utilisateurs d’interagir avec le système même sans expertise technique. En coulisses, l’outil assure une organisation optimale, vérifie automatiquement les erreurs et aide les chercheurs à créer des métadonnées précises et de haute qualité. L’architecture de madbot est conçue pour être facilement extensible, permettant ainsi son intégration avec diverses solutions de stockage de données, entrepôts de données et normes de métadonnées. Cette flexibilité permet aux chercheurs d’adapter l’outil à leurs besoins spécifiques, garantissant une interopérabilité parfaite avec différentes infrastructures de recherche. En simplifiant le processus de soumission des données de recherche, madbot encourage les chercheurs à adopter les principes de la science ouverte, rendant ainsi leurs travaux plus accessibles. En définitive, madbot contribue à réduire les obstacles au partage des données de recherche et facilite la contribution des scientifiques à la communauté scientifique internationale.
À qui s’adresse cet outil ?
Accessible à tous les chercheurs.euses, ingénieurs.es et équipes de la communauté scientifique.
Tarification
L’utilisation de madbot est gratuite pour les utilisateurs académiques.
Citer madbot
Logo, colorimétrie, Typographie, about, citation, … rendez-vous sur le site internet de madbot.
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Actualités 2026
12 mai : Version 1.5.0
5 mai : présentations à 2 Printemps de la donnée
- au « Curathon – les outils d’accompagnement, à la croisée des disciplines » à Poitiers avec une présentation de Thomas Denecker
- au Curathon à Nantes avec une présentation d’Imane Messak et Baptiste Rousseau

20 avril : madbot au Printemps de la donnée à Clermont-Ferrand
Après une présentation de Thomas Denecker et Baptiste Rousseau de l’équipe madbot, ils ont animé un atelier autour du training set, disponible sur Zenodo.
17 avril : madbot est référencé sur Cat Opidor !
13 avril : Version 1.4.0
1ᵉ avril : Présentation de madbot à l’Institut Pasteur (actualité site IFB)

13 mars : Version 1.3.0
14 janvier : Présentation de l’outil lors du Biostream des JeBiF, live de bioinformatique. Replay disponible sur Youtube
Janvier : Lancement auprès de la communauté (actualité sur le site IFB)
Actualités 2025
Décembre : Mise en production et annonce du lancement au All-hands IFB/ELIXIR-FR
