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L’IFB/ELIXIR-FR et ses plateformes proposent un ensemble de services pour accompagner la recherche : ressources de données, outils logiciels, infrastructures de calcul, formations, science ouverte, groupes de travail et animation de communautés. Engagé dans des projets innovants comme le développement de fédérations de données (FEGA), l’IFB contribue à construire des approches intégrées pour répondre aux enjeux One Health.
Services proposés par l'IFB/ELIXIR-FR
- Bilille
- BIRD
- Curie
- DAC / ICM
- IFB-core
- InforBio
- Hub bioinformatique de Pasteur
- MicroScope
- MMG
- TAGC
- MIGALE
Certaines plateformes proposent des services d’accompagnement (autour de la gestion des données, l’implémentation de workflows, l’analyse de données, l’interprétation de résultats, …), des collaborations de projets ou encore des partenariats avec des équipes de recherche pour le montage de projet. Vous pouvez contacter une plateforme selon votre zone géographique.
- ABRomics
- sciences.orphadata.com (ECDR, GCBR)
- ANISEED
- IMGT
- BISE
- MATRIXDB
- ParameciumDB
- GenomeHubs
- MicroScope
- SulfAtlas
- GENOMICUS
- Norine
- GnpIS
- Ocean Gene Atlas
- AuReme
- LifeMap
- MetExplore
- Remap
- Workflow4metabolomics
- Orphanet (OrphaData)
Les ressources de données sont à retrouver directement dans le catalogue de l’IFB/ELIXIR-FR.
- ABRomics : la plateforme sécurisée, multisectorielle et ouverte visant à analyser les données génomiques et métagénomiques dans un cadre de recherche et surveillance en antibiorésitance
- EMERGEN-Bioinfo : la plateforme numérique du programme français de surveillance génomique et de recherche sur le SARS-CoV-2
Pour les données non sensibles (modèles animaux, …), l’ensemble du NNCR est à votre disposition.
Pour les données de santé / associées à la santé (génomique humaine, transcriptomique humaine, données personnelles, données potentiellement identifiantes), nous vous invitons à vous tourner vers les alternatives HDS :
- CINES – certification HDS à venir
- Inserm
- …
- Migale Annotation et Comparaison de génomes bactériens – en savoir plus sur le site de la plateforme Migale
Pour les formations multi-domaines, consultez l’offre de formation de l’IFB/ELIXIR-FR.
Retrouvez les ressources du RDMkit ELIXIR (la boîte à outils de gestion des données de recherche pour les sciences de la vie) par sous-domaines :
- FR – C1-Santé coordonné par l’IFB-core
- EU – ELIXIR Rare Diseases Community
- EU – ELIXIR Federated Human Data Community
- EU – ELIXIR Human Copy Number variation Community
- EU – ELIXIR Cancer Data Community
- FEGA – Metadata working group
- EU – EOSC Life Science Node