Les 16 et 17 juillet, les équipes de développement de ces deux projets portés par l’IFB se sont réunies à l’Institut Pasteur pour un hackathon dédié à la finalisation du plugin ABRomics pour madbot. Deux journées de travail consacrées au développement d’un plugin entre les deux outils, avec pour objectif commun de permettre aux utilisateurs de la plateforme ABRomics de soumettre leurs données sans jongler manuellement entre les 2 outils.
Crédits photos – IFB/ELIXIR-FR
Évolution de madbot autour des besoins de la communauté d’ABRomics
En parallèle de la finalisation du plugin, il était nécessaire d’étendre les capacités de madbot : l’outil pourra ainsi prendre en charge la soumission de données d’assemblage génomique à l’ENA (European Nucleotide Archive).
Un plugin plus robuste entre les deux plateformes
Grâce à ce travail collaboratif entre les équipes dev de madbot et d’ABRomics, le plugin qui relie les deux outils gagne en maturité. Cette avancée s’inscrit parallèlement dans une dynamique d’interopérabilité au sein de l’IFB, au bénéfice des communautés utilisatrices de la surveillance de l’antibiorésistance et de la bioinformatique génomique.
Pour utiliser la plateforme ABRomics, dédiée à l’amélioration de la surveillance et la recherche sur la résistance aux antibiotiques !
Pour découvrir et adopter madbot, l’outil essentiel pour faciliter la gestion et le partage de données, c’est par ici !