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L’IFB/ELIXIR-FR et ses plateformes proposent un ensemble de services pour accompagner la recherche : ressources de données, outils logiciels, infrastructures de calcul, formations, science ouverte, groupes de travail et animation de communautés.
Services proposés par l'IFB/ELIXIR-FR
- ABiMS
- Genotoul-Bioinfo
- GenOuest/BIPAA
- IFB-core
- MicroScope
- Migale
- SouthGreen
- URGI
Certaines plateformes proposent des services d’accompagnement (autour de la gestion des données, l’implémentation de workflows, l’analyse de données, l’interprétation de résultats, …), des collaborations de projets ou encore des partenariats avec des équipes de recherche pour le montage de projet. Vous pouvez contacter une plateforme selon votre zone géographique.
- Services pas inscrits au SDP ELIXIR* :
- Siduri
- BIPAA
- BBIP
- SniPlay
- GreenPhyl
- RapGreen
- South Green Portal ( portail de ressources et documentation de South Green)
- SDP-ELIXIR-FR :
- AgroLD
- GnpIS
- Gigwa
- GenomeHubs
- Portails: FAIDARE, WheatIS
Les ressources de données sont à retrouver directement dans le catalogue de l’IFB/ELIXIR-FR.
- Cloud4SAMS
- DIANE
- GeMO
- VCFHunter
- FrangiPane
- Panache
- PanExplorer
- SynFlow
- Culebront
- Toggle
- D-Genies
SDP ELIXIR-FR :
- Gigwa
L’intégralité de notre offre tout domaine thématique (uniquement données non sensibles) est disponible sur notre page dédiée.
Serveur Galaxy national UseGalaxy.fr : Les domaines thématiques disponibles sont listés sur notre page dédiée également.
- Plateforme URGI – Fair-Data Miappe et les autres
Pour les formations multi-domaines, consultez l’offre de formation de l’IFB/ELIXIR-FR.
Des outils généralistes et multi-domaines sont à disposition, comme Fair-checker / madbot / DSW.
La plateforme URGI développe une offre de service dédiée à la gestion FAIR des données Plantes et à leur intégration.
Vous pouvez par ailleurs retrouver les guidelines spécifiques à ce domaine thématique du RDMkit ELIXIR (la boîte à outils de gestion des données de recherche pour les sciences de la vie) :
- ELIXIR – EU :
- ELIXIR Plant Science community
- ELIXIR Domestic Animals community
- ELIXIR Biodiversity community
- ELIXIR Food and nutrition community
- ELIXIR Microbiome community
Autres ESFRIs :
- EMPHASIS
International :
- Consortium MIAPPE
- Consortium BrAPI
- Consortium international FAANG (animaux domestiques)