Sur le volet publications en science ouverte, l’IFB/ELIXIR-FR est engagé pour un partage en libre accès des résultats des travaux réalisés en interne. Dans ce contexte, nous publions et encourageons aux publications sur HAL.
Collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL
La collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL, qui regroupe les collections de nos plateformes membres et de notre unité coordinatrice, est créée depuis début septembre 2026.
Collection IFB-core sur HAL
Toutes les publications de l’IFB-core sont présentes sur notre collection, dont sont issues les dernières publications ci-dessous.
Dernières publications de l’IFB-core
Riocreux-Verney Benjamin, Marie Verneret, Christine Dolmazon, Shirin Ashraf, Stella Atim, et al.
Unraveling viral identity: Avoiding the trap of endogenous sequences for viral surveillance of small ruminant oncogenic retroviruses.
Microbes 2026, le 21e Congrès National de la Société Française de Microbiologie, Oct 2026, Lyon, France. ⟨hal-05737914⟩.
Julie Lao, Raphaël Tackx, Amanda Dieuaide, Thomas Mignon, Cléa Siguret, et al.
ABRomics: a platform for antibiotic resistance research and public health using an integrated "One Health" approach.
ECCB 2026 - 25th European Conference on Computational Biology, Aug 2026, Geneva, Switzerland. ⟨hal-05732017⟩.
Julie Lao, Raphaël Tackx, Amanda Dieuaide, Thomas Mignon, Cléa Siguret, et al.
ABRomics: a platform for antibiotic resistance research and public health using an integrated "One Health" approach.
ECCB 2026 - 25th European Conference on Computational Biology, Aug 2026, Geneva, Switzerland. ⟨hal-05725740⟩.
Paul Zierep, Mina Hojat Ansari, Patrick Bühler, Santino Faack, Bruno Fosso, et al.
FAIRyMAGs - a series of FAIR Galaxy workflows for the generation of metagenome assembled genomes. 2026.
Rodolfo Rondon, Felipe León, Marcelo González-Aravena, Elisa Bergami, Cristián Chaparro, et al.
Nanoplastic and metal-oxides transcriptomic responses and oxygen consumption analysis in the Antarctic clam Laternula elliptica.
Journal of Hazardous Materials Advances, 2026, pp. 101470. ⟨10.1016/j.hazadv.2026.101470⟩. ⟨hal-05714599⟩.
Remerciements et affiliations dans les publications
Affiliations dans les publications pour les personnels de l’IFB-core (UAR3601)
La rédaction des affiliations dans les publications pour les personnels de l’Unité UAR3601 doit se faire sous ce format :
Affiliations dans les publications pour l’utilisation de ressources physique et logicielles du NNCR
La rédaction des affiliations dans les publications qui ont bénéficié de l’utilisation des serveurs du NNCR (cluster et cloud) doit se faire sous ce format :
Publication résultant du financement PIA1 IFB
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Publication résultant des financements de MUDIS4LS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Publication résultant des financements des projets IFB et MUDIS4LS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB et PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Publication résultant des financements de ABBA
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PI4 projet ABBA (Accelerating Bioinformatics for Biology Applications), nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Publication résultant des financements de ABRomics
Pour toute publication ayant bénéficié du financement ABRomics, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

Publication résultant des financements de BYTE-Sea
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR ATLASea – Programme et Équipement Prioritaire de Recherche exploratoire, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Publication résultant des financements de Cloud4SAMS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement Cloud4SAMS – projet ciblé du Programme et Équipement Prioritaire de Recherche SAMS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Utilisation de l’outil madbot
Si vous utilisez madbot dans votre travail, veuillez le citer comme suit :

Publication résultant des financements de NEUROVASC
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR Santé Numérique – Involvement in the NeuroVasc axis, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Publication pour les autres projets
Le projet maDMP4LS (machine-actionable Data Management Plans for Life Sciences) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0017-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.
Le projet OpenLink (Une passerelle entre les outils de gestion de données d’imagerie pour appliquer les principes FAIR) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0011-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.
