Sur le volet publications en science ouverte, l’IFB/ELIXIR-FR est engagé pour un partage en libre accès des résultats des travaux réalisés en interne. Dans ce contexte, nous publions et encourageons aux publications sur HAL.
Collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL
Une collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL est en cours de préparation. Dans l’attente de sa mise en service, nous vous invitons à retrouver les collections de nos différentes plateformes et de notre unité coordinatrice.
Collection IFB-core sur HAL
Toutes les publications de l’IFB-core sont présentes sur notre collection, dont sont issues les dernières publications ci-dessous.
Dernières publications de l’IFB-core
From Principles to Practice: Enabling FAIRification from laboratories to Research Infrastructures. 2026.
Pixi : La gestion de paquets rendue simple.
Séminaire du groupe thématique "FAIR et reproductibilité" du Réseau MERIT, Le Réseau MetiER en bIoinformaTique du CNRS, May 2026, Villejuif, France. ⟨hal-05636103⟩.
Machine learning-based prediction of memory requirements for metagenomic assembly in high-performance computing environments. 2026.
Ground-truth Construction and Evaluation of LLM Contribution to Life Sciences Tool Annotation.
LLM4KGOE 2026 - Workshop on LLM-driven Knowledge Graph and Ontology Engineering, Co-located with ESWC 2026, Aryan Singh Dalal; Kathleen Jagodnik; Maria Maleshkova; Hande McGinty; Cogan Shimizu, May 2026, Dubrovnik, Croatia. ⟨hal-05631723⟩.
Federated SPARQL querying for genomic variant functional annotation.
European Semantic Web Conference 2026, European Semantic Web Conference 2026 Organising Committee, May 2026, Dubrovnik, Croatia. ⟨hal-05619026⟩.
Remerciements et affiliations dans les publications
Affiliations dans les publications pour les personnels de l’IFB-core (UAR3601)
La rédaction des affiliations dans les publications pour les personnels de l’Unité UAR3601 doit se faire sous ce format :
Affiliations dans les publications pour l’utilisation de ressources physique et logicielles du NNCR
La rédaction des affiliations dans les publications qui ont bénéficié de l’utilisation des serveurs du NNCR (cluster et cloud) doit se faire sous ce format :
Publication résultant du financement PIA1 IFB
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements de MUDIS4LS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements des projets IFB et MUDIS4LS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB et PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements de ABBA
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PI4 projet ABBA (Accelerating Bioinformatics for Biology Applications), nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Publication résultant des financements de ABRomics
Pour toute publication ayant bénéficié du financement ABRomics, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Publication résultant des financements de BYTE-Sea
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR ATLASea – Programme et Équipement Prioritaire de Recherche exploratoire, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements de Cloud4SAMS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement Cloud4SAMS – projet ciblé du Programme et Équipement Prioritaire de Recherche SAMS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Utilisation de l’outil madbot
Si vous utilisez madbot dans votre travail, veuillez le citer comme suit :
Publication résultant des financements de NEUROVASC
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR Santé Numérique – Involvement in the NeuroVasc axis, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication pour les autres projets
Le projet maDMP4LS (machine-actionable Data Management Plans for Life Sciences) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0017-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.
Le projet OpenLink (Une passerelle entre les outils de gestion de données d’imagerie pour appliquer les principes FAIR) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0011-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.