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L’engagement pour la recherche

Des projets nationaux et européens

L’Institut français de bioinformatique contribue ou coordonne des projets scientifiques nationaux et européens, au travers de financements PIA, PEPR et modes de financements français, ainsi que par sa participation aux projets européens via Elixir et le développement des infrastructures en bioinformatique.
Cette participation illustre son engagement dans le développement des infrastructures et la recherche scientifique en Biologie-Santé.

Remerciements et affiliation

Les remerciements et affiliations pour chacun des projets sont à retrouver dans la rubrique dédiée.
Déposer sur HAL les publications relatives aux projets, dans le cadre de l’obligation.

ABBA

Accélération de la Bioinformatique pour les Biologiques Applications
Période : 2025 - 2029
Financement : ANR-24-INBS-0010-IFB-ABBA
Financement (complément) : PIA4 / Jouvence des équipements et nouvelles offres technologiques des infrastructures en biologie santé 2023
Rôle de l'IFB : Coordinateur

Le projet Advanced Bioinformatics for Biological Applications (ABBA, 1,6 M€), vise à compléter l’équipement informatique financé par le projet PIA3 MUDIS4LS.

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ABRomics

Résistance aux antimicrobiens
Période : 2022 - 2026
Financement : PPR Antibiorésistance
Rôle de l'IFB : Coordinateur

L'antiobiorésistance, i.e. la capacité des bactéries à résister aux traitements par antibiotiques, constitue un problème sanitaire mondial majeur. Face à ce défi, le projet ABRomics, co-porté par…

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AgroServ

integrated SERVices supporting a sustainable AGROecological transition
Période : 2022 - 2027
Financement : HORIZON-INFRA-2021-SERV-01-02
Financement (complément) : Research infrastructures services for a sustainable and resilient agriculture and agro-ecological transitions
Rôle de l'IFB : Membre

Les services intégrés soutenant une transition agroécologique durable (AgroServ) faciliteront une approche systémique et holistique pour comprendre les menaces et les défis auxquels l'agriculture est…

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BYTE-SEA

Phrase explicative de l’acronyme
Période : 2023 - 2031
Financement : ANR-22-EXAT-0004
Financement (complément) : PEPR ATLASea, l'Atlas des génomes marins
Rôle de l'IFB : Co-coordinateur

Le domaine de la génomique a connu ces 20 dernières années une révolution majeure en fournissant de nouvelles connaissances sur la diversité biologique et biochimique de la vie. La baisse du coût du…

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Cloud4SAMS

Espaces numériques sécurisés pour l'accès et l’analyse des données du PEPR SAMS
Période : 2024-2028
Financement : ANR-24-PESA-0003
Financement (complément) : PEPR Systèmes Alimentaires, Microbiome et Santé
Rôle de l'IFB : Coordinateur

Le projet ciblé Cloud4SAMS vise à déployer une infrastructure numérique distribuée permettant aux chercheurs d’exploiter les données de microbiome et de santé dans un environnement informatique…

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ELIXIR Metabolomics

Période : 2024-2028
Financement : CoS ELIXIR
Financement (complément) : ELIXIR work program 2024-2028
Rôle de l'IFB : Co-coordinateur

la plateforme d'outils ELIXIR vise à maintenir et étendre ses services pour faciliter la recherche, l'accessibilité, l'interopérabilité et la réutilisabilité des outils informatiques afin de répondre…

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ELIXIR BioDiv-FAIR-Checker

Raising FAIRness of European biodiversity data through ELIXIR-aligned standards, services and training
Période : 2026-2027
Financement : CoS ELIXIR - work program 2024-2028
Financement (complément) : Volet scientifique du programme : Biodiversity food security and pathogen (BFSP)
Rôle de l'IFB : Lead (Task 2), Member (Task 1, Task 3)

ELIXIR BioDiv-FAIR-Checker vise à améliorer la conformité des données sur la biodiversité européenne aux principes FAIR grâce à des normes, des services et une formation alignés sur ELIXIR.

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ELIXIR DATAREX

Data Management for Research in ELIXIR
Période : 2024-2025
Financement : CoS ELIXIR - Programme ELIXIR 2019-2023
Rôle de l'IFB : Member (WP2, WP3)

La gestion des données de recherche (RDM) est essentielle à la mise en œuvre des principes FAIR et Open Science. DATAREX permet de faciliter le partage des connaissances, développer des ressources…

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ELIXIR FAIRyMAGs

Optimising Metagenomics Assembled Genomes building
Période : 2024-2026
Financement : CoS ELIXIR - work program 2024-2028
Financement (complément) : Volet scientifique du programme : Biodiversity food security and pathogen (BFSP)
Rôle de l'IFB : Membre (activity 1 et 3) et co-lead (activity 2 et 4)

ELIXIR FAIRyMAGs vise à faire progresser la recherche métagénomique en développant, optimisant et diffusant des workflows FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) dédiés à la construction…

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ELIXIR HARVEST

Période : 2024-2026
Financement : CoS ELIXIR
Financement (complément) : ELIXIR work program 2024-2028
Rôle de l'IFB : Co-coordinateur et membre

ELIXIR HARVEST vise à optimiser les ressources existantes en s’appuyant sur des standards de données reconnus (MIAPPE, ISA, ARC, RO-Crate) pour faciliter l’accès et la réutilisation des données…

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ELIXIR INTOXICOM

Integrating the Toxicology Community into ELIXIR (INTOXICOM)
Période : 2024-2026
Financement : CoS ELIXIR - ELIXIR work program 2019-2023
Rôle de l'IFB : Membre

En reconnaissant l'importance de la toxicologie, ELIXIR a créé une communauté dédiée à cette discipline. Elle a pour objectif d'aligner les solutions FAIR et les données ouvertes issues de la…

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ELIXIR STEERS

Période : 2024 - 2027
Financement : HORIZON-INFRA-2023-DEV-01
Rôle de l'IFB : Membre

L'objectif d'ELIXIR-STEERS est de permettre aux utilisateurs de l'ensemble de l'Espace européen de la recherche d'accéder à des données fédérées et de réaliser des analyses transfrontalières à grande…

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