L’IFB et ses plateformes régionales œuvrent à la science ouverte sur de nombreux plans : que cela soit par la mise à disposition de ressources de calculs et stockages mutualisés, la complétion de ses ressources par des solutions de gestion de workflows, ou la démocratisation des containers ou des environnements virtuels, ou encore des formations proposées à différents publiques, ou finalement le développement d’outils et services pour accompagner les scientifiques aux différentes étapes du cycle de vie des données.
Des ressources pour des sciences plus ouvertes et faciliter l'interopérabilité
L’IFB œuvre de différentes manières pour la science ouverte, notamment en :
- Contribuant à la définition des principes et orientations en matière de Science ouverte sur les données en biologie-santé
- Développant des outils dans une démarche de science ouverte.
Parmi ces outils, nous pouvons citer notamment MadBot, FairChecker, ou encore l’instance française de DSW. Pour en savoir plus sur ces ressources
- en intégrant la R&D pour de futurs services dans son programme scientifique.
Données
Données de la recherche
Deux axes stratégiques du programme scientifique piloté par l’IFB-core concernent les données de recherche :
- Orchestration des flux de données (FAIRisation, gestion des données, suivi de projets, accompagnement des chercheurs pour le dépôt) ;
- Ressources de données (préservation, pérennisation, sécurisation, ouverture et partage) ;
Dans ce cadre, les ressources logicielles proposées en tant que service poursuivent leur développement :
- DSW : interopérabilité avec DMP-OPIDOR
- Madbot : mise en production, développement de nouveaux connecteurs vers d’autres entrepôts
- FairChecker : intégration de l’IA
L’IFB/ELIXIR-FR est pilote ou partenaire de grands projets nationaux et européens incluant des nouveaux développements touchant la thématique Science Ouverte des données :
- MUDIS4LS : l’objectif est d’orchestrer les flux de données de biologie-santé tout au long de leur cycle de vie depuis leur production jusqu’à leur exploitation
- PEPR ATLASEA, projet BYTE-SEA
- Ferment du Futur via la plateforme MIGALE
Logiciels
Logiciels et codes sources
L’IFB participe au groupe de travail CNRS autour du logiciel dans la science ouverte, pour CNRS Biologie.