Descriptif du projet
La communauté métabolomique ELIXIR s’appuie sur le développement et l’adoption de normes, de formats et de solutions de traitement des données, mais il reste difficile de garantir des métadonnées de haute qualité, des résultats suffisamment contextualisés, des ensembles de données interopérables et réutilisables, et d’intégrer ces données métabolomiques à d’autres études ou données omiques.
Ce projet est conçu pour répondre à ces problèmes et vise à relier les principales normes internationales aux ressources ELIXIR, ainsi qu’à créer des lignes directrices et des supports de formation associés pour la communauté.
Sur la base du cadre FAIRification, les activités du projet permettront :
- d’accroître l’interopérabilité et la réutilisation des ensembles de données et des flux de travail métabolomiques publics grâce à des normes de données ouvertes améliorées et étendues, à des ressources et à de nouvelles annotations sémantiques ;
- de définir, de garantir et d’établir un contrôle de qualité pour les bases de référence des études en métabolomique et en exposomique ;
- de faciliter l’interprétation des données métabolomiques et l’intégration de la méta-analyse avec les études multi-omiques et de biologie des systèmes.
Actualités
16 et 17 février 2026 – Workshop ELIXIR sur la métabolomique sémantique à Groningen
ELIXIR France, en collaboration avec ELIXIR ES, DE, NL, EMBL-EBI, CZ, organise un workshop de deux jours sur la métabolomique sémantique, à Groningen dans le cadre du projet de « Next level of reproducible, comparable, and integrable Metabolomics » (RCI-M). Lancé en janvier 2025 pour une durée de 20 mois, ce projet ELIXIR est co-dirigé par Franck Giacomoni (IFB-ELIXIR-FR). Le programme de l’atelier se concentrera en particulier sur les premiers résultats du projet, dédié à l’harmonisation des données, à la modélisation sémantique et aux normes de métadonnées pour les études métabolomiques. Un deuxième objectif sera également d’explorer les possibilités d’enrichir les annotations et de les intégrer dans les profils métabolomiques au sein de l’écosystème des différentes omiques afin de progresser vers des comparaisons d’études plus solides et une interprétation plus fiable de nos données.
Pour en savoir plus, retrouvez l’agenda scientifique de ce workshop et les slides sur Github.