Publications - IFB

Dernières publications
Citer l'infrastructure IFB

Sur le volet publications en science ouverte, l’IFB/ELIXIR-FR est engagé pour un partage en libre accès des résultats des travaux réalisés en interne. Dans ce contexte, nous publions et encourageons aux publications sur HAL.

Collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL

Une collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL est en cours de préparation. Dans l’attente de sa mise en service, nous vous invitons à retrouver les collections de nos différentes plateformes et de notre unité coordinatrice.

Collection IFB-core sur HAL

Toutes les publications de l’IFB-core sont présentes sur notre collection, dont sont issues les dernières publications ci-dessous.

Retrouvez toute la collection sur HAL

Dernières publications de l’IFB-core

Baptiste Rousseau, Elora Vigo, Imane Messak.

Presentation of madbot at BioStream.

Biostream, Jan 2026, Remote, United States. 2026. ⟨hal-05458776⟩.

Vivek Ashokan, Clara Emery, Agnès Barnabé, Valentin Loux, Christina Pavloudi, et al.

MiCoReCa (Microbiome Community Resource Catalogue) - Towards Centralized Curation And Integration Of Microbiome Bioinformatics Resources. 2026.

⟨hal-05443844⟩.

Frédéric de Lamotte, Véronique Stoll, Céline Hernandez, Cécile Arènes, Romain David, et al.

Faciliter la documentation des données grâce aux métadonnées dans un projet de recherche.

Comité pour la science ouverte. 2025. ⟨hal-05455660⟩.

Mamadou Dia Sow, Cristian Forestan, Caroline Pon, Peter Civan, Raffaella Battaglia, et al.

Author Correction: Striking convergent selection history of wheat and barley and its potential for breeding.

Nature Plants, 2025, ⟨10.1038/s41477-025-02182-8⟩. ⟨hal-05403169⟩.

Perinelle Naïa, Thomas Lacroix, Hélène Chiapello, Guillaume Kon Kam King, Arnaud Ferré, et al.

Feedback from Evo.

GT LEGO - Journées du GDR BIMMM, GDR BIMMM, Nov 2025, Nantes, France. ⟨hal-05388811⟩.

Remerciements et affiliations dans les publications

Affiliations dans les publications pour les personnels de l’IFB-core (UAR3601)

La rédaction des affiliations dans les publications pour les personnels de l’Unité UAR3601 doit se faire sous ce format :

IFB-core, French Institute of Bioinformatics (IFB), CNRS, INSERM, INRAE, CEA, 94800 Villejuif, France.

Affiliations dans les publications pour l’utilisation de ressources physique et logicielles du NNCR

La rédaction des affiliations dans les publications qui ont bénéficié de l’utilisation des serveurs du NNCR (cluster et cloud) doit se faire sous ce format :

The bioinformatics analyses were performed on the HPC facilities of the National Network of Computing Resources of the Institut Français de Bioinformatique (IFB), funded by the Programme d’Investissements d’Avenir (PIA), grant Agence Nationale de la Recherche number ANR-11-INBS-0013

Publication résultant du financement PIA1 IFB

Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

The French Institute of Bioinformatics (IFB) was founded by the Future Investment Program subsidized by the National Research Agency, number ANR-11-INBS-0013.

Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo

Publication résultant des financements de MUDIS4LS

Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

This work received state aid managed by the National Research Agency under France 2030 for structural research equipment / EQUIPEX+ with reference ANR-21-ESRE-0048.

Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo

Publication résultant des financements des projets IFB et MUDIS4LS

Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB et PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

This work received state aid managed by the National Research Agency under France 2030 for the French Institute of Bioinformatics (IFB), founded by the Investments for the Future Program, number ANR-11-INBS-0013, as well as for structural research equipment / EQUIPEX+ with reference ANR-21-ESRE-0048.

Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo

Publication résultant des financements de ABBA

Pour toute publication ayant bénéficié du financement PI4 projet ABBA (Accelerating Bioinformatics for Biology Applications), nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

This work received state aid managed by the National Research Agency under France 2030 as part of the “Jouvence” program of the Health Plan, for the ABBA project with reference ANR-24-INBS-0010 IFB-ABBA..

Publication résultant des financements de ABRomics

Pour toute publication ayant bénéficié du financement ABRomics, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

This (type of publication) received financial support from the Priority Research Program on Antibiotic Resistance (PPR Antibiorésistance), coordinated by Inserm and funded by the General Secretariat for Investment (SGPI).

Publication résultant des financements de BYTE-Sea

Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR ATLASea – Programme et Équipement Prioritaire de Recherche exploratoire, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

The exploratory research program “ATLASea: Atlas of Marine Genomes” and the targeted project BYTE-Sea (ANR-22-EXAT-0004) benefit from state aid managed by the National Research Agency (ANR) as part of the “France 2030” future investment plan.

Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo

Publication résultant des financements de Cloud4SAMS

Pour toute publication ayant bénéficié du financement Cloud4SAMS – projet ciblé du Programme et Équipement Prioritaire de Recherche SAMS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

This work received state aid managed by the National Research Agency under France 2030 with reference “ANR-24-PESA-0003”.

Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo

Publication résultant des financements de NEUROVASC

Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR Santé Numérique – Involvement in the NeuroVasc axis, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :

This project received state aid managed by the National Research Agency under France 2030 with reference “ANR-22-PESN-0008”.

Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo

Publication pour les autres projets

Le projet maDMP4LS (machine-actionable Data Management Plans for Life Sciences) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0017-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.

Le projet OpenLink (Une passerelle entre les outils de gestion de données d’imagerie pour appliquer les principes FAIR) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0011-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.