Sur le volet publications en science ouverte, l’IFB/ELIXIR-FR est engagé pour un partage en libre accès des résultats des travaux réalisés en interne. Dans ce contexte, nous publions et encourageons aux publications sur HAL.
Collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL
Une collection IFB/ELIXIR-FR sur HAL est en cours de préparation. Dans l’attente de sa mise en service, nous vous invitons à retrouver les collections de nos différentes plateformes et de notre unité coordinatrice.
Collection IFB-core sur HAL
Toutes les publications de l’IFB-core sont présentes sur notre collection, dont sont issues les dernières publications ci-dessous.
Dernières publications de l’IFB-core
A Standards-Based Knowledge Graph that Bridges Scientific Workflows, Run-Time Provenance, and Tool Registries.
SWAT4HCLS 2026, Mar 2026, Amsterdam, Netherlands. ⟨hal-05517640⟩.
PanGBank: a database of pangenome graphs for comparative microbial genomics.
EAGS 2026 - International Environmental and Agronomical Genomics symposium, Feb 2026, Paris, France. eags2026.sciencesconf.org. ⟨hal-05523557⟩.
Sandbox.
bio tutorials – Linux basics training modules (IFB ELIXIR-FR). École thématique. France. 2026. ⟨hal-05506951⟩.
BReIF: une e-infrastructure pour accélérer l'utilisation de ressources biologiques diversifiées.
Trans Numériques 2026, Feb 2026, Rennes, France. inria.invityou.com. ⟨hal-05514911⟩.
Compte rendu du Colloque sur la journée des données des Plateformes d'Alliance Sorbonne Université.
Journée des données des plateformes d'Alliance Sorbonne Université, Jun 2025, Paris, France. 2026. ⟨mnhn-05482143⟩.
Remerciements et affiliations dans les publications
Affiliations dans les publications pour les personnels de l’IFB-core (UAR3601)
La rédaction des affiliations dans les publications pour les personnels de l’Unité UAR3601 doit se faire sous ce format :
Affiliations dans les publications pour l’utilisation de ressources physique et logicielles du NNCR
La rédaction des affiliations dans les publications qui ont bénéficié de l’utilisation des serveurs du NNCR (cluster et cloud) doit se faire sous ce format :
Publication résultant du financement PIA1 IFB
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements de MUDIS4LS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements des projets IFB et MUDIS4LS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PIA1 IFB et PIA4 ESR/Equipex+ MUDIS4LS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements de ABBA
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PI4 projet ABBA (Accelerating Bioinformatics for Biology Applications), nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Publication résultant des financements de ABRomics
Pour toute publication ayant bénéficié du financement ABRomics, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Publication résultant des financements de BYTE-Sea
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR ATLASea – Programme et Équipement Prioritaire de Recherche exploratoire, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Publication résultant des financements de Cloud4SAMS
Pour toute publication ayant bénéficié du financement Cloud4SAMS – projet ciblé du Programme et Équipement Prioritaire de Recherche SAMS, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
Les supports de communication orale, les communications par voie d’affiche, les sites internet doivent également afficher le logo France 2030. Télécharger le logo
Utilisation de l’outil madbot
Si vous utilisez madbot dans votre travail, veuillez le citer comme suit :
Publication résultant des financements de NEUROVASC
Pour toute publication ayant bénéficié du financement PEPR Santé Numérique – Involvement in the NeuroVasc axis, nous demandons d’inclure la phrase suivante dans la section « Funding » ou « Acknowledgement » selon le cas :
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Publication pour les autres projets
Le projet maDMP4LS (machine-actionable Data Management Plans for Life Sciences) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0017-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.
Le projet OpenLink (Une passerelle entre les outils de gestion de données d’imagerie pour appliquer les principes FAIR) a bénéficié du financement ANR-19-DATA-0011-01 dans le cadre de l’appel Flash “Science ouverte : pratiques de recherche et données ouvertes”.